“三统一，三结合”原则为河南省中医药治疗艾滋病试点项目的工作方针和指导原则。
统一组织领导。保证了河南省中医药治疗艾滋病试点项目总体的方针方案和政策规划能通过各级项目管理部门组织实施，并进一步落实到每个患者。
统一治疗方案。试点项目开展初期，多数专家对艾滋病还不够了解，对其常见症状、证候演变规律还不熟悉，接触患者时很难做到快速、有效地对症治疗。必须融合既有的中医药治疗艾滋病诊疗经验和各学科专家智慧，形成统一的治疗方案，以便项目专家快速掌握有效的艾滋病中医药治疗方法。
统一观察指标。主要是为了全面掌握患者情况，方便对患者管理以对比观察疗效，同时也对艾滋病的科研工作有重要的样本意义。
临床救治与科研相结合。从短期来看，中医药治疗艾滋病试点项目主要是政府对艾滋病患者的救治项目。从长期来看，试点项目中数千份临床数据和资料，对艾滋病的科研有较大的样本意义。临床救治能立竿见影地为艾滋病患者减轻痛苦、提高生命质量，而基于临床救治的科学研究、科研成果将为艾滋病患者带来长效福音。
固定方药与辨证施治相结合。艾滋病患者的共同特点是，免疫系统遭到破坏，因免疫力下降感染多种疾病。然而，每个艾滋病患者所处的艾滋病分期不同，自身所生存的环境也不同，临床会表现出不同的机会性感染。基于此，项目确定此原则。
中医药治疗与抗病毒治疗相结合。一方面，艾滋病治疗要降低患者体内艾滋病毒数量，减少艾滋病其对免疫细胞的破坏，西药抗病毒药物虽然有一些毒副作用，对机会性感染效果不佳，但是其抗病毒效果非常显著；另一方面，艾滋病治疗要提高机体免疫能力，增强抵抗艾滋病毒的能力和抵御机会性感染的能力，中医药治疗在这方面具有明显优势，同时也可以在很大程度上提高抗病毒药物的疗效。临床数据表明，同时接受中医药和抗病毒治疗的患者的各项指标，明显优于单纯抗病毒治疗的患者。