奥美拉唑是著名的抑酸类药物，由于它疗效确切，价格低，是非处方药，可以随意购买，因此易导致滥用。
过度使用奥美拉唑等抑酸类药物，可导致胃酸浓度降低，酸性减弱，胃里的病菌就可能进入肠道，使肠道受到感染，引起腹泻。因胃酸降低影响消化，进而影响肠道对钙、铁等微量元素及维生素的吸收，导致机体缺钙，易发生骨折。国外有研究显示，奥美拉唑还会增加人们患急性间质性肾炎的风险。
专家建议，患者要对症使用、按疗程使用奥美拉唑等抑酸类药物，这类药只适合胃酸分泌过多引起的消化系统疾病，而因为胃酸分泌过多而引起的胃食管反流、溃疡等病则不适合用。另外，病人要按疗程服用，连续服用不要超过4周。