一些观点认为空腹时不能喝酸奶，其实不然。
认为空腹不能喝酸奶的观点称，酸奶中含有大量乳酸菌，空腹时饮用，乳酸菌在酸度较高的胃里容易大量死亡，丧失了部分的保健作用。吃了大量食物之后，胃酸度下降，可以更好地让乳酸菌发挥作用。其实，普通酸奶由保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌发酵而成，其中的乳酸菌本身就不能在肠道中定殖，它是一过性的保健菌。只有嗜酸乳杆菌、双歧杆菌等某些特定保健菌种才有希望繁殖。所以喝普通酸奶时其实不用担心乳酸菌浪费的问题。
还有人认为，酸奶酸度高，可刺激胃，引起胃溃疡。这要从酸奶的酸度来分析：酸奶的制作原理是利用了牛奶中酪蛋白遇酸沉淀的特性。酪蛋白一旦在pH4．5以下，就变成凝块状。因此酸奶的pH一般保持在5左右。而胃酸的pH一般在2左右，因此酸奶的酸度与胃酸比起来，酸性并不强，即使空腹喝酸奶也不会对胃造成刺激。有些胃溃疡或胃酸多的人空腹喝酸奶会觉得胃不舒服，应当注意避免空腹喝，其他的人都可以空腹喝酸奶。