微波炉所发出的电磁波如果泄漏超过一定限量，可导致人的体温升高，或器官细胞部分病变，还会干扰人体自身磁场，诱发疾病。研究发现，人体长时间受到微波辐射，可引起头晕、目眩、乏力、消瘦、脱发等症状。
微波炉要放置在通风的地方，在微波炉的上、后、左、右都要留有10厘米以上的通风空间，和电视机、冰箱等电器保持一定的距离。因为这几种电器放置在一起，磁场互相干扰叠加，对人体的危害更大，且附近不要有磁性物质，以免干扰内磁场的均匀状态，使工作效率下降。
微波炉的工作频率是2450兆赫，在这一频段上，人体最易受微波伤害的部位是眼睛的晶状体。微波炉观察窗的微波泄漏比微波炉其他部位大。因此，切忌在微波炉下作时观察炉内烹饪的食物。微波炉工作时人应离开微波炉1．5米以上距离。
平时应保持炉门密封垫及相应接触面的清洁，及时清除夹在中间的食物颗粒等，以防密封不严而导致微波泄漏。可用软布蘸酒精擦拭进行清洁。炉门一旦损伤变形，可能引起微波泄漏，应轻开轻关。