苍耳子性温，味辛、苦，有小毒，人肺、肝经，具有散风、祛湿、止痛、通鼻窍、杀虫等功效。可用于风寒头痛、鼻渊流涕、风疹瘙痒、湿痹拘挛等病。苍耳子临床上还有多种功效，但本药有小毒，须在医生指导下使用。
治慢性鼻炎：苍耳子40克，辛夷8克，麻油250毫升。先将麻油温热后加入已打碎的苍耳子和辛夷，浸泡24小时后，再用文火熬煮至沸，待麻油熬至约200毫升左右，冷却、过滤，装瓶备用。每天滴鼻3次，每次2滴。
治疟疾：鲜苍耳子30克，洗净捣烂，加水煎15分钟去渣，打人鸡蛋2个，煮熟，在发作前将药液与鸡蛋同服。可连服2-5剂。
治牙痛：苍耳子6克，焙焦去壳，研成细末，与一个鸡蛋和匀，不放油盐，炒熟食之，每日1剂，连服3剂。
治下肢溃疡：苍耳子60-120克，炒黄研末，生猪板油120-180克，共捣如泥糊状，洗净疮面，擦干后涂药糊，外用绷带包扎。